Beth si risveglia dal coma e Daniel, sempre impegnato con la sua clinica clandestina, deve delle risposte, sia a lei che alla polizia.
Mentre Beth indaga per scoprire il segreto di Daniel, quest'ultimo e Lee devono reagire a una nuova e complicata situazione.
Anna, in attesa del processo, deve decidere se mettere da parte i suoi principi morali. L'incontro con Eve diventa un punto di svolta per Lee.
Anna ritorna nel bunker con un piano da mettere in atto e ha bisogno di Daniel, ma il medico sembra essere sparito nel nulla.
Mentre la polizia è sempre più vicina alla verità, Daniel scopre qual è il prezzo da pagare per aver sfidato Gubby.
Daniel e Anna decidono di partire, rischiando di essere catturati ai posti di blocco, ma il viaggio cambierà la loro vita per sempre.
Lee, ormai attivista convinto, si prepara a cambiare il mondo. Daniel non vuole che sua figlia paghi per i suoi errori. Anna fa una scoperta sconcertante.